2023
01/19
相关创新主体

创新背景

海洋病毒物种通过感染另一种生物体,劫持宿主的细胞机器来复制自己。虽然这种感染可能对宿主产生负面影响,但病毒的活动可能对环境有益,例如通过帮助消散有害藻华。

 

创新过程

法国的研究团队从基因组片段中获取有关RNA病毒的功能和宿主的信息,定义了海洋病毒在生态系统中的位置。团队使用了几种方法来确定可能的宿主,首先根据海洋浮游生物背景下的病毒分类推断宿主,然后根据病毒和宿主的数量如何“共同变化”进行预测。第三种策略是找到RNA病毒整合到细胞基因组中的证据。

虽然大多数dnDNA病毒感染海洋中丰富的细菌和古细菌,但这项新的分析发现,RNA病毒主要感染微生物真菌和真核生物,在较小程度上感染无脊椎动物。只有一小部分海洋RNA病毒感染细菌。

研究在95种RNA病毒中分析发现了72个可识别且功能不同的代谢辅助基因(MGA)。这些结果在确定这些病毒的宿主和工作中的代谢过程方面特别有用,他们正试图重新编程以最大限度地“制造”海洋中的病毒。

进一步的网络分析确定了1,243种与碳出口有关的RNA病毒,其中11种可能与向海底的出口有关。其中,两种与藻类家族宿主有关的病毒被选为最有希望的监测目标。

这些RNA病毒是在塔拉海洋收集的浮游生物样本中检测到的,这是塔拉号纵帆船上正在进行的一项全球研究,证明气候变化对世界海洋的影响。

 

创新关键点

科学家在塔拉海洋收集的样本中发现了5,500种海洋RNA病毒,发现其中一些可能有助于从大气中吸收碳并将其永久储存在海底。分析表明这些新发现的物种中有一小部分从它们感染的生物体中“窃取”了基因,有助于确定它们在海洋过程中的假定宿主和功能。

 

创新价值

研究结果有助于使人们更好地了解了这些微小颗粒在海洋生态系统中发挥的重要作用。

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